MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 1585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011311	GTC	2	6	24214	24219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778371
502	NC_011311	CGT	2	6	24288	24293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778371
503	NC_011311	AAG	2	6	24329	24334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778371
504	NC_011311	TCA	2	6	24341	24346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778371
505	NC_011311	CAA	2	6	24357	24362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
506	NC_011311	CAA	2	6	24403	24408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
507	NC_011311	AC	3	6	24431	24436	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
508	NC_011311	GCA	2	6	24452	24457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778371
509	NC_011311	CCA	2	6	24464	24469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778371
510	NC_011311	AAG	2	6	24470	24475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778371
511	NC_011311	A	6	6	24499	24504	100 %	0 %	0 %	0 %	215778371
512	NC_011311	CCA	2	6	24539	24544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778371
513	NC_011311	AACA	2	8	24559	24566	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
514	NC_011311	AGAGC	2	10	24585	24594	40 %	0 %	40 %	20 %	215778371
515	NC_011311	CAAC	2	8	24677	24684	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
516	NC_011311	ATG	2	6	24694	24699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778371
517	NC_011311	GACAAA	2	12	24709	24720	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	215778371
518	NC_011311	CAA	2	6	24783	24788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
519	NC_011311	A	6	6	24787	24792	100 %	0 %	0 %	0 %	215778371
520	NC_011311	ATT	2	6	24842	24847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778371
521	NC_011311	TCA	2	6	24896	24901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778371
522	NC_011311	TCG	2	6	24936	24941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778371
523	NC_011311	CAA	2	6	25023	25028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
524	NC_011311	GAC	2	6	25033	25038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778371
525	NC_011311	AAAG	2	8	25078	25085	75 %	0 %	25 %	0 %	215778371
526	NC_011311	A	6	6	25171	25176	100 %	0 %	0 %	0 %	215778371
527	NC_011311	CAAA	2	8	25235	25242	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
528	NC_011311	GCT	2	6	25425	25430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778371
529	NC_011311	TCA	2	6	25502	25507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778371
530	NC_011311	CG	4	8	25522	25529	0 %	0 %	50 %	50 %	215778371
531	NC_011311	CAA	2	6	25537	25542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
532	NC_011311	ATT	3	9	25597	25605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778371
533	NC_011311	GAC	2	6	25606	25611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778371
534	NC_011311	TCA	2	6	25645	25650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778371
535	NC_011311	CCG	2	6	25751	25756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215778371
536	NC_011311	CGT	2	6	25803	25808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778371
537	NC_011311	ATT	2	6	25840	25845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778371
538	NC_011311	ATTA	2	8	25869	25876	50 %	50 %	0 %	0 %	215778371
539	NC_011311	CAACA	2	10	25879	25888	60 %	0 %	0 %	40 %	215778371
540	NC_011311	TAA	3	9	25914	25922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778371
541	NC_011311	AAT	2	6	25935	25940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778371
542	NC_011311	ACA	2	6	25961	25966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
543	NC_011311	TCA	2	6	25967	25972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778371
544	NC_011311	ACCA	2	8	26038	26045	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
545	NC_011311	A	6	6	26130	26135	100 %	0 %	0 %	0 %	215778371
546	NC_011311	CAA	2	6	26145	26150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
547	NC_011311	AAG	2	6	26186	26191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778371
548	NC_011311	AAGA	2	8	26234	26241	75 %	0 %	25 %	0 %	215778371
549	NC_011311	AGA	2	6	26244	26249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778371
550	NC_011311	GAAC	2	8	26250	26257	50 %	0 %	25 %	25 %	215778371
551	NC_011311	AAC	2	6	26354	26359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
552	NC_011311	TC	3	6	26454	26459	0 %	50 %	0 %	50 %	215778372
553	NC_011311	CAT	2	6	26476	26481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778372
554	NC_011311	TTC	2	6	26492	26497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778372
555	NC_011311	GAGT	2	8	26514	26521	25 %	25 %	50 %	0 %	215778372
556	NC_011311	AAC	2	6	26556	26561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778372
557	NC_011311	CTT	2	6	26563	26568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778372
558	NC_011311	TCAC	2	8	26583	26590	25 %	25 %	0 %	50 %	215778372
559	NC_011311	TCT	2	6	26610	26615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778372
560	NC_011311	CGC	2	6	27405	27410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215778373
561	NC_011311	TTC	2	6	27448	27453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778373
562	NC_011311	GA	3	6	27602	27607	50 %	0 %	50 %	0 %	215778373
563	NC_011311	CAC	2	6	27648	27653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778373
564	NC_011311	TTCA	2	8	27675	27682	25 %	50 %	0 %	25 %	215778373
565	NC_011311	TAA	2	6	27748	27753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778373
566	NC_011311	ATA	2	6	27900	27905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778374
567	NC_011311	TAT	2	6	27963	27968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778374
568	NC_011311	T	6	6	28013	28018	0 %	100 %	0 %	0 %	215778374
569	NC_011311	TAT	2	6	28029	28034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778374
570	NC_011311	AGG	2	6	28046	28051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215778374
571	NC_011311	ACA	2	6	28062	28067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778374
572	NC_011311	T	6	6	28117	28122	0 %	100 %	0 %	0 %	215778374
573	NC_011311	TTG	2	6	28140	28145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778374
574	NC_011311	ACA	2	6	28166	28171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778374
575	NC_011311	TGA	2	6	28213	28218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778374
576	NC_011311	GTT	2	6	28229	28234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778374
577	NC_011311	TAT	2	6	28235	28240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778374
578	NC_011311	CAT	2	6	28251	28256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778374
579	NC_011311	GGC	2	6	28353	28358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215778375
580	NC_011311	AAT	2	6	28365	28370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778375
581	NC_011311	CAAC	2	8	28395	28402	50 %	0 %	0 %	50 %	215778375
582	NC_011311	GGT	2	6	28578	28583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215778375
583	NC_011311	GGC	2	6	28621	28626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215778375
584	NC_011311	AT	3	6	28629	28634	50 %	50 %	0 %	0 %	215778375
585	NC_011311	TTA	2	6	28663	28668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778375
586	NC_011311	CCA	2	6	28765	28770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778375
587	NC_011311	TCA	2	6	28820	28825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778375
588	NC_011311	CT	3	6	28834	28839	0 %	50 %	0 %	50 %	215778375
589	NC_011311	TCA	2	6	28840	28845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778375
590	NC_011311	TCT	2	6	28858	28863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778375
591	NC_011311	TCG	2	6	28889	28894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778375
592	NC_011311	GCTT	2	8	28936	28943	0 %	50 %	25 %	25 %	215778375
593	NC_011311	CAG	2	6	28982	28987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778375
594	NC_011311	CAA	2	6	28995	29000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778375
595	NC_011311	GC	3	6	29024	29029	0 %	0 %	50 %	50 %	215778375
596	NC_011311	AGA	2	6	29052	29057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778375
597	NC_011311	AAT	2	6	29115	29120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778375
598	NC_011311	TAA	2	6	29129	29134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778375
599	NC_011311	T	7	7	29162	29168	0 %	100 %	0 %	0 %	215778375
600	NC_011311	TTGAG	2	10	29277	29286	20 %	40 %	40 %	0 %	215778375
601	NC_011311	TTG	2	6	30224	30229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778376
602	NC_011311	TGT	2	6	30283	30288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778376
603	NC_011311	ACA	2	6	30296	30301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778376
604	NC_011311	GCC	2	6	30362	30367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215778376
605	NC_011311	GAG	2	6	30375	30380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215778376
606	NC_011311	ATAA	2	8	30463	30470	75 %	25 %	0 %	0 %	215778376
607	NC_011311	ACTT	2	8	30643	30650	25 %	50 %	0 %	25 %	215778377
608	NC_011311	ATG	2	6	30664	30669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778377
609	NC_011311	ATC	2	6	30689	30694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778377
610	NC_011311	TAAC	2	8	30702	30709	50 %	25 %	0 %	25 %	215778377
611	NC_011311	TTGATA	2	12	30712	30723	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	215778377
612	NC_011311	TCA	2	6	30726	30731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778377
613	NC_011311	GTTT	2	8	30874	30881	0 %	75 %	25 %	0 %	215778377
614	NC_011311	TAA	2	6	30882	30887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778377
615	NC_011311	A	6	6	30886	30891	100 %	0 %	0 %	0 %	215778377
616	NC_011311	TCT	2	6	30920	30925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778377
617	NC_011311	AC	3	6	30934	30939	50 %	0 %	0 %	50 %	215778377
618	NC_011311	TCATT	2	10	31050	31059	20 %	60 %	0 %	20 %	215778377
619	NC_011311	TCA	2	6	31062	31067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778377
620	NC_011311	A	6	6	31367	31372	100 %	0 %	0 %	0 %	215778378
621	NC_011311	CA	3	6	31383	31388	50 %	0 %	0 %	50 %	215778378
622	NC_011311	CAA	2	6	31412	31417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778378
623	NC_011311	GCG	2	6	31427	31432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215778378
624	NC_011311	A	6	6	31468	31473	100 %	0 %	0 %	0 %	215778378
625	NC_011311	GAA	2	6	31478	31483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778378
626	NC_011311	GCG	2	6	31526	31531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215778378
627	NC_011311	GCAA	2	8	31577	31584	50 %	0 %	25 %	25 %	215778378
628	NC_011311	AAG	2	6	31617	31622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778378
629	NC_011311	TGAA	2	8	31626	31633	50 %	25 %	25 %	0 %	215778378
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